Уединенное место стало прибежищем монахов в 1845‒1850 годах. Название скит получил в честь Иерусалимского сада и чудотворного образа Божьей Матери Черниговской. Икона хранилась здесь в XIX веке, но в советское время была утрачена. Практически все постройки скита пережили события XX века, но требовали реставрации. Возрождение монашеской жизни началось в 1990-х годах. Сегодня на территории святого места можно увидеть пятиярусную колокольню с двумя приделами из красного кирпича, монашеские кельи, подземные пещеры, часовню и святой источник. В наши дни скит является подворьем Свято-Троицкой Сергиевой лавры и открыт для посещения.